Cette décision de fermeture du site vient quelques jours seulement après les diverses protestations et revendications contre la nouvelle proposition de loi américaine « Sopa », mais les autorités affirment que cette décision de mise hors ligne a été prise pendant la première semaine du mois de janvier. Les autorités américaines ont déclaré que les deux co-fondateurs de Megaupload « Kim Dotcom », anciennement connu sous le nom de Kim Schmitz et « Mathias Ortmann » ont été interpellés à Auckland en Nouvelle-Zélande avec deux autres employés de l'entreprise.

Selon les déclarations du FBI, cette action est parmi les plus grands cas de piratage jamais réalisé aux États-Unis et vise directement le détournement d'un stockage de contenu public. Pour le FBI, Megaupload permettait la distribution illégale de la propriété intellectuelle. L'annonce est venue quelques heures seulement après que des milliers de sites ont pris part à un "Blackout" pour protester contre la loi sur le piratage en ligne (Sopa) et la Protection de propriété intellectuelle (PIPA).